A SEGA revelou que a equipe de desenvolvimento Dimps, parceiros da SEGA há muito tempo, e responsáveis por vários jogos do Sonic, estão desenvolvendo Sonic Lost World para o 3DS. A SEGA também falou sobre algumas coisas que existem na versão para 3DS que não existem na versão do jogo para Wii U.
Takashi Iizuka disse que os layouts de nível são totalmente diferentes para corresponder ao tamanho da tela e hardware para que os jogadores possam desfrutar de ambas as versões sem reclamar. A versão do 3DS também vai incluir um modo exclusivo, onde até quatro jogadores podem jogar, inclui um modo exclusivo contra para até quatro jogadores, e também há várias coisas que você vai poder desbloquear se vincular a versão do jogo para 3DS com a sua versão para Wii U.
